Конец IV века, древний город Александрия является последним бастионом умирающей Римской империи. И здесь, где когда-то цвели наука и культура, вспыхивает новая религия, христианство, зарождающееся в низах общества и приобретающее все большую политическую власть. В этом период исторического перехода и бурлящего социального конфликта живет Гипатия - необычайно образованная женщина, философ, математик и астроном.
Она - свет мудрости в мире, погружающемся в темноту, и ключевой игрок в великой исторической драме. Гипатия обладает необычайным влиянием на правителей и их решения, а ее интеллект и знания вызывают восхищение у тех, кто знаком с ее работой. Она стремится преодолеть религиозный фанатизм и сохранить научные знания, преследуемая властями и обществом, которому она служит.
Но судьба бросает ей вызов в лице религиозного фанатизма, который угрожает уничтожить все, что она любит и ценит. Это история о борьбе за свободу мысли и научную правду в мире, где старые убеждения сходят на нет, а новые приводят к кровавым столкновениям. "Агора" - это отражение реальности, где наука и религия столкнулись в жестокой борьбе за власть над умами и сердцами людей.